Disciplinas obrigatórias fundamentais 
DisciplinaCódigo
Química Analítica AvançadaQUI 2220
Química Inorgânica AvançadaQUI 2221
Físico-química AvançadaQUI 2431
Química Orgânica AvançadaQUI 2647
Laboratório de Química AvançadaQUI 2222
Disciplinas obrigatórias complementares
Outras disciplinas obrigatórias consideradas complementares na formação dos alunos incluem: (i) 2 disciplinas de Seminários; (ii) Estágio Docência na Graduação (obrigatória para bolsistas CAPES e recomendada para bolsistas CNPq); (iii) Exame de proficiência em línguas; (iv) Exame de Qualificação, exclusivo para alunos de doutoramento. Os alunos de doutoramento também devem cumprir a disciplina “produção científica do doutorado”, que consta em ter artigo aceito para publicação versando sobre tema da tese.
Disciplinas optativas 
DisciplinaCódigo
Pesquisa de Tese IQUI 2051
Pesquisa de Tese IIQUI 2052
Catálise HeterogêneaQUI 2432
EletroanalíticaQUI 2524
EspectroscopiaQUI 2525
Métodos Espectrométricos IQUI 2526
Métodos Espectrométricos IIQUI 2527
Espectrometria de MassaQUI 2528
Radioquímica AplicadaQUI 2529
Química AmbientalQUI 2530
Química AtmosféricaQUI 2531
Produção de Textos CientíficosQUI 2532
Geoquímica Orgânica MarinhaQUI 2533
Análises TérmicasQUI 2534
Fontes Alternativas de EnergiaQUI 2535
Tópicos Especiais de Química OrgânicaQUI 2640-2642
Tópicos Especiais de Química InorgânicaQUI 2611-2613
Tópicos Especiais de Química AnalíticaQUI 2627-2629
Tópicos Especiais de Físico-QuímicaQUI 2632-2634
Cinética de Reações QuímicasQUI 2638
Tópicos Especiais de BioquímicaQUI 2653-2655
Química AquáticaQUI 2684
Química OceanográficaQUI 2685
Química ComputacionalQUI 2689
Laboratório de Métodos Espectrométricos IQUI 2723
Métodos Espectrométricos IIIQUI 2725
Laboratório de Métodos Espectrométricos IIQUI 2741
Seminário IIQUI 2881
Metrologia QuímicaQUI 2950
Estágio SupervisionadoQUI 2990
Estágio Supervisionado IIQUI 2991